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单细胞全基因组测序技术（scWGS）可以有效揭示生物样品中不同细胞之间的异质性，并系统鉴定单个细胞的基因组中发生的遗传变化，例如拷贝数变异（CNV）和点突变（单核苷酸变异，SNV）等。过去十年，研究人员已经开发出多种单细胞基因组扩增技术，例如简并寡核苷酸引物PCR扩增技术(DOP-PCR)、多重置换扩增技术（MDA）、多重退火和基于环的扩增循环技术（MALBAC），以及通过转座子插入和体外转录进行...
空气污染相关肺癌的基因组突变特征被揭示（图）
空气污染 肺癌 基因组 突变特征
2015/4/14
资料显示，全球80%的居民生活在超过世界卫生组织空气质量标准的空气之中，空气污染既影响发达国家，也威胁发展中国家民众的健康。根据已有的致癌证据，世界卫生组织下属的国际癌症研究机构(IARC)已将室外、室内空气污染列为一类致癌原。近来，柴静的记录片《穹顶之下》的播出，再次引起公众对空气污染的关注和热议。在该片，柴静提到了云南省宣威市这个我国肺癌发病率较高的地区。该地烟煤储量丰富，居民在日常生活和工业...
上海交通大学团队在基因组DNA片段编辑技术上取得新进展
上海交通大学 团队 基因组DNA片段编辑技术
2015/3/13
上海交通大学系统生物医学研究院吴强教授团队在Journal of Molecular Cell Biology杂志上（IF8.432）发表了题为“EfficientInversions and Duplications of Mammalian Regulatory DNA Elements andGene Clusters by CRISPR/Cas9”的研究成果。
2014年12月22日，中国科学院精准基因组医学重点实验室2014年度学术年会暨第一届学术委员会会议在北京基因组研究所召开。本次会议共有12名学术委员会委员出席，包括重点实验室学术委员会主任沈岩院士，副主任曾益新院士，学术委员会委员陈润生院士、季加孚教授、李林院士、王小宁教授、吴仲义院士、王前飞研究员、徐涛研究员、杨运桂研究员、张学敏院士、曾长青研究员。与会领导和嘉宾有中科院前沿科学与教育局的生命...
日本血吸虫基因组核糖体移码序列的预测分析
日本血吸虫 核糖体移码 假结 生物信息学
2013/11/25
目的预测日本血吸虫基因组中核糖体移码的基因序列并进行鉴定。方法挑选稳定并能够可靠预测RNA假结结构的软件，编写批量提交数据的程序并结合本地手段进行假结结构预测，计算序列最小自由能从而挑选稳定序列，进一步使用生物信息学软件Fsfinder分析序列中核糖体移码位点，进行开放性阅读框（open reading frame，ORF）分析，筛选出可能产生核糖体移码的日本血吸虫基因序列。利用日本血吸虫蛋白质组...
李川昀，副研究员。2004-2009年就学于北京大学生命科学学院，获理学博士学位。曾作为访问学者在美国国家医学研究院（NIH）从事药物成瘾研究工作，并于2010年11月起任职北京大学分子医学研究所，负责建设系统生物学实验室。曾参与多个国家重点科研项目，在PLoS Computational Biology，Nucleic Acids Research等国际期刊发表多篇SCI论文。其针对药物成瘾基因...
上海交通大学生命学院细菌比较基因组学研究取得系统性进展
上海交通大学生命学院 细菌比较 基因组学 系统性进展
2011/11/7
近日，国际知名分子生物学刊物《Nucleic Acids Research》在线发表了上海交通大学微生物代谢国家重点实验室邓子新研究团队2010级博士生毕德玺为第一作者的论文“ICEberg: 基于web的细菌整合型接合元件资源”。这是继去年7月和今年1月《Nucleic Acids Research》先后报道了“mGenomeSubtractor: 基于并行计算的细菌基因组差减杂交模拟工具” 和...