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肠道菌群被认为是抗生素抗性基因（ARGs）的重要储库，易将ARGs转移至易感微生物和环境中，造成潜在的健康风险。在“同一健康”框架下，ARGs在植物、动物、人类和环境的微生物群落中传播，肠道菌群往往承担着关键纽带作用。