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基于TCGA数据库的前列腺癌组织免疫细胞浸润模式预测
前列腺癌 免疫细胞 TCGA数据库 预后
2021/3/3
研究前列腺癌组织中免疫细胞的浸润模式及其与临床预后之间的相关性。方法TCGA数据库下载前列腺癌mRNA表达数据及临床资料，通过CIBERSORT软件预测前列腺癌组织中22种免疫细胞的浸润模式，应用R语言分析各种免疫细胞与生存的相关性。
利用TCGA数据库建立预测肾透明细胞癌预后的自噬相关基因预后模型，分析自噬相关基因预后模型与肾透明细胞癌各临床病理特征之间的关系。方法通过R语言软件筛选出TCGA数据库中肾透明细胞癌样本及正常样本中差异表达的自噬相关基因，Cox比例风险回归模型从中筛选和建立多基因预后模型，计算预后评分。根据预后评分的中位数将患者分为高风险组和低风险组。利用KaplanMeier生存曲线分析高风险组及低风...