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基于TCGA数据库的前列腺癌组织免疫细胞浸润模式预测
前列腺癌 免疫细胞 TCGA数据库 预后
2021/3/3
研究前列腺癌组织中免疫细胞的浸润模式及其与临床预后之间的相关性。方法TCGA数据库下载前列腺癌mRNA表达数据及临床资料，通过CIBERSORT软件预测前列腺癌组织中22种免疫细胞的浸润模式，应用R语言分析各种免疫细胞与生存的相关性。
利用TCGA数据库建立预测肾透明细胞癌预后的自噬相关基因预后模型，分析自噬相关基因预后模型与肾透明细胞癌各临床病理特征之间的关系。方法通过R语言软件筛选出TCGA数据库中肾透明细胞癌样本及正常样本中差异表达的自噬相关基因，Cox比例风险回归模型从中筛选和建立多基因预后模型，计算预后评分。根据预后评分的中位数将患者分为高风险组和低风险组。利用KaplanMeier生存曲线分析高风险组及低风...
通过对肿瘤基因组图谱（the concet genome atlas，TCGA）的相关数据进行分析，以得到长链非编码 RNA （long non-coding RNA，lncRNA）及其下游靶分子，对60 岁以上急性髓系白血病 （acute myeloid leukemia， AML）人群预后影响的相关信息。方法 将TCGA 数据库中60 岁以上AML 患者样本，根据美国国立综合癌症网络 （NCC...
基于TCGA数据库分析NOX4基因在胃癌组织中的表达及预后
胃癌 NADPH氧化酶4 预后
2020/8/6
通过研究NADPH氧化酶4（NOX4）在胃癌（STAD）组织中的表达及其与临床病理学参数的相关性，阐明其在STAD预后中的重要作用。方法：运用GEPIA大数据分析NOX4在正常胃组织和胃癌组织中的表达差异和其对胃癌预后的影响。再运用LinkedOmics大数据分析NOX4与STAD临床病理学参数和胃癌临床分期的相关性。